Fakultas Ekonomi Universitas Islam Sumatera Utara (FE UISU) didirikan oleh Yayasan Universitas Islam Sumatera Utara pada tanggal 16 Februari 1957 yang merupakan Fakultas Ekonomi Swasta tertua di Sumatera. Pada awal berdirinya Fakultas Ekonomi mengasuh jurusan Ekonomi Umum dan Ekonomi Perusahaan dan perkembangan berikutnya tepatnya pada tahun 1980 jurusan Ekonomi Umum berubah menjadi jurusan Studi Pembangunan dan Ekonomi perusahaan berubah menjadi jurusan Manajemen hingga saat ini.

Fakultas Ekonomi Universitas Islam Sumatera Utara (FE UISU) didirikan oleh Yayasan Universitas Islam Sumatera Utara pada tanggal 16 Februari 1957 yang merupakan Fakultas Ekonomi Swasta tertua di Sumatera. Pada awal berdirinya Fakultas Ekonomi mengasuh jurusan Ekonomi Umum dan Ekonomi Perusahaan dan perkembangan berikutnya tepatnya pada tahun 1980 jurusan Ekonomi Umum berubah menjadi jurusan Studi Pembangunan dan Ekonomi perusahaan berubah menjadi jurusan Manajemen hingga saat ini.

Kemudian pada tahun 1981 berdasarkan SK Menteri Pendidikan dan Kebudayaan RI No.0170/0/1981 tanggal 22 Desember 1981 Fakulas Ekonomi memperoleh status terdaftar untuk jurusan Ilmu Ekonomi dan Studi Pembangunan dan jurusan manajemen. Selanjutnya berdasarkan SK Menteri Pendidikan dan Kebudayaan RI No.0339/0/1985 tanggal 29 Juli 1985 jurusan Ilmu Ekonomi dan Studi Pembangunan dan Manajemen memperoleh status disamakan.

Kemudian khususnya jurusan manajemen mengalami perkembangan dan kemajuan yang cukup pesat dalam memenuhi kebutuhan dan tuntutan perkembangan zaman maka pada tahun 1993 Pemerintah memberikan izin pembukaan Program Magister Manajemen berdasarkan SK Dijend. Dikti No.560/Dikti/Kep/1993.

Pada tahun 1998 jurusan Ilmu Ekonomi dan Studi Pembangunan dan jurusan Manajemen memperoleh Akreditasi dari BAN PT. Setelah itu, untuk mengantisipasi kebutuhan dan permintaan masyarakat Fakultas Ekonomi mendapat izin untuk membuka program studi / jurusan Akuntansi berdasarkan SK Mendiknas No. 2563/D/T/2001 tanggal 02 agustus 2001.

Oleh karena itu sampai saat ini FE UISU mengasuh 3(tiga) jurusan/Program Studi yaitu :
a. Program Studi Ilmu Ekonomi dan Studi Pembangunan
b. Program Studi Manajemen
c. Program Studi Akuntansi